In de meeste huishoudens staat een magnetron, tegenstanders van de magnetron beweren dat het gebruik hiervan de voeding in gezondheidswaarde kan verminderen en zelfs schadelijk voor de gezondheid kan zijn. Voorstanders beweren dat hiervoor onvoldoende bewijs is geleverd.
Wat zeker is gebleken uit onderzoek is dat de magnetron, de gezonde anti-oxidanten in groenten (ook wel flavonoïden genoemd) met 97% afbreekt, terwijl als je de groenten zou stomen de voedingswaarde degeneratie minimaal is.
Een deel van de Nederlanders heeft een tekort aan Vitamine B12 , dit wordt door opwarmen in de magnetron ook voor 30-40% afgebroken wat natuurlijk zonde is.
De anti kanker eigenschappen van knoflook zijn na 60 seconden magnetron bereiding verdwenen.